沒有進入排名可能意味著有些大學被外國博士生、“世界級”科學家、學術伙伴和慈善家所忽視，例如：

大學排名時，所列入的標準和數(shù)據(jù)，最易于反映生物科學的研究成果。相對于社會科學范圍內(nèi)的建筑、創(chuàng)意、人文和美術則不易反映其研究成果。諸如工程、商業(yè)和教育等專業(yè)學科，向來沒有悠久的同行評議、不以名師出高徒為傳統(tǒng)，也不易反映出對社會發(fā)展的重要貢獻和真正實力。

排名起初有重視校友社經(jīng)地位、畢業(yè)后貢獻和學術聲譽的傾向，其中擁有歷史悠久和資金充裕的學府，通常是偏向發(fā)達國家中的醫(yī)學院。這種排名標準使發(fā)展中國家的大學無法與歐美的重點大學在同一個起跑點上競爭。再者菁英教育和大眾教育之間的差別，以及發(fā)達國家和發(fā)展中國家大學之間的鴻溝也可能會擴大他們的優(yōu)劣勢。

有一個特別的問題是，排名使某一時刻的品質(zhì)與定義會留下一種固定的印象;而高等教育機構的使命是多樣化的，所以僅僅把重點放在科學研究的實力上，會忽略了其他的維度，諸如教學、社區(qū)參與、第三職能、創(chuàng)新性，以及社會和經(jīng)濟影響。

高等教育機構是復雜的組織，不同的院系和活動皆有不同的優(yōu)勢和弱點。根據(jù)所使用的標準和指標/權重的不同，對優(yōu)秀程度的定義也可能變化。由于排名計算總分，使高等教育的復雜性被減少至一種具有意義的數(shù)據(jù)上，而差別被夸大了。

盡管存在這些批評，俄羅斯、中國大陸、臺灣、印度、日本、韓國、歐洲各國政府仍然非常努力于建立自己的世界級大學。